Plantată în 1300, podgoria de la Château Pape-Clément este cea mai veche din Bordeaux. În 1306, la numirea lui Bertrand de Goth, Arhiepiscop de Bordeaux, ca papă, podgoria a luat numele papal al acestuia - Clement al V-lea. Tot el este și cel care o face cadou succesorului său - Cardinalul Arnaud de Canteloup. Bertrand este cel care a plantat cu varietăți de struguri roșii. Varietățile de struguri albi au fost plantate de-a lungul râului, în apropiere de Lormont. Château Pape-Clément a rămas în proprietatea arhiepiscopilor de Bordeaux până la naționalizarea de la Revoluția franceză din 1789. 

După Revoluție, diverși proprietari s-au succedat la cârma cramei, făcând ca până la mijlocul secolului al XIX-lea să devină a doua din regiune, după Haut-Brion. Deși sub cârma lui Jean-Baptiste Clerc vinurile se vindeau la prețuri de Médoc, proprietarii următori, inclusiv englezul Maxwell, au neglijat proprietatea, făcând ca aceasta să cunoască un declin până la cel de-al Doilea Război Mondial.

Începând cu 1939, Château Pape-Clément a fost revitalizat de Paul Montagne, rezultatele reconstruirii de la zero find vizibile abia începând cu 1949. De la angajarea enologului Émile Peynaud, vinurile Pape-Clément au cunoscut o ascensiune fulminantă, fiind descrise de David Peppercorn ca cele mai importante din Pessac-Talence, după Haut-Brion și La Mission.

După moartea lui Paul Montagne, fiul acestuia, Léo Montagne a urmat la cârmă, alături de Bernard Magrez, proprietarul de la Château La Tour Carnet și care l-au angajat pe postul de consultant pe Michel Rolland.